cDNA基因百度文库由PCR物质构成，金属的氨基化处理，为发夹结构构造，长短一般在百余至千余碱基对，因此芯片的混种杂交标准对每一个基因无法保证是好的，假阳性率比较高，因而，氨基化处理方法，判断cDNA微阵列的后的结果时，必须对挑选出的基因开展测序。在应用cDNA微阵列开展研究时，一般需要提供一个对比样版，把与必须研究的样本给与不同类型的标识，将二者灯亮混匀一同引入芯片开展孵育。扫描仪后所得到的原始记录是每个表格中中网络信号的比例。 
基因芯片技术由于同时将大量探针固定于支持物上，所以可以一次性对样品大量序列进行检测和分析，什么是氨基化处理，从而解决了传统核酸印迹杂交（Southern Blotting 和 Northern Blotting 等）技术操作繁杂、自动化程度低、操作序列数量少、检测效率低等不足。而且，通过设计不同的探针阵列、使用特定的分析方法可使该技术具有多种不同的应用价值，如基因表达谱测定、实变检测、多态性分析、基因组文库作图及杂交测序等。
2）用点样法固定在玻璃板上的DNA探针阵列，通过与荧光标记的靶基因杂交进行检测。这种方法点阵密度可有较大的提高，各个探针在表面上的结合量也比较一致，北京氨基化处理，但在标准化和批量化生产方面仍有不易克服的困难。3）在玻璃等硬质表面上直接合成的寡核苷酸探针阵列，与荧光标记的靶基因杂交进行检测。该方法把微电子光刻技术与DNA化学合成技术相结合，可以使基因芯片的探针密度大大提高，减少试剂的用量，实现标准化和批量化大规模生产，有着十分重要的发展潜力。
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