物理吸附是简单的抗体固定化方法，包括静电作用、疏水作用、极性相互作用等非共价键作用。优点显而易见—省时省力省钱，缺点也是不可避免—（1）抗体偶联的取向（orientation）不可控，DNA的固定方法，完全由概率来确定；（2）物理吸附作用力弱，应用时有抗体脱离现象。学中，经常用到物理吸附的地方就是一抗的负载过程。比如在ELISA板（聚）和侧流试纸条（纤维素膜）等表面负载抗体的时候，DNA 固定方法，用到的就是物理吸附作用。
原位合成法主要为光引导聚合技术，DNA固定，它不仅可用于寡聚核苷酸的合成，也可用于合成寡肽分子。光引导聚合技术是照相平板印刷技术（ photolithography ）与传统的核酸、多肽固相合成技术相结合的产物。半导体技术中曾使用照相平板技术法在半导体硅片上制作微型电子线路。固相合成技术是当前多肽、核酸人工合成中普遍使用的方法，技术成熟且已实现自动化。二者的结合为合成高密度核酸探针及短肽阵列提供了一条快捷的途径。
正如电子管电路向晶体管电路和集成电路发展时所经历的那样，核酸杂交技术的集成化也已经和正在使分子生物学技术发生着一场革命。现在全世界已有十多家公司专门从事基因芯片的研究和开发工作，且已有较为成型的产品和设备问世。主要代表为美国 Affymetrix 公司。该公司聚集有多位计算机、数学和分子生物学，其每年的研究经费在一千万美元以上，且已历时六七年之久，拥有多项。
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