早在八十年代， Bains W. 等人就将短的 DNA 片断固定到支持物上，借助杂交方式进行序列测定。但基因芯片从实验室走向工业化却是直接得益于探针固相原位合成技术和照相平板印刷技术的有机结合以及激光共聚焦显微技术的引入。它使得合成、固定高密度的数以万计的探针分子切实可行，而且借助基因芯片激光共聚焦显微扫描技术使得可以对杂交信号进行实时、灵敏、准确的检测和分析。产品即将或已有部分投放市场，产生的社会效益和经济效益令人瞻目。
该方法的主要优点是可以用很少的步骤合成极其大量的探针阵列。例如，合成 48 （ 65536 ） 个探针的 8 聚体寡核苷酸序列仅需 4 × 8=32 步操作，抗体固定化技术， 8 小时就可以完成。而如果用传统方法合成然后点样，抗体固定化，那么工作量的巨大将是不可思议的。同时，用该方法合成的探针阵列密度可高达到 106/cm2 。不过，尽管该方法看来比较简单，elisa固定抗体，实际上并非如此。
目前， 在医学研究中 ， 数据分析方法在总体上分为两大类:无监控集簇分析和有监控集簇分析。前者比较单纯的从数学角度按照基因表达的相似性将基因分组 ， 这有助于发现新的目的基因或提供新的疾病信息 ， 如新的分型 、 影响预后的因素等。后者需要结合现有的知识进行分析， 适用于疾病归类。这对于传统诊断手段是一个有益的补充。
另外，江西抗体固定， 在目前进行的许多微阵列芯片研究中，每次研究的基因数目很大 ， 而参与实验的样本量较少。这一现象不利于得到稳定的和具有良好可重复性的实验结果。
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