除了光引导原位合成技术外,有的公司如美国 Incyte Pharmaceuticals 等使用压电打印法 (Piezoelectric printing) 进行原位合成。其装置与普通的彩色喷墨打印机并无两样,二氧化硅修饰表面氨基,所用技术也是常规的固相合成方法。做法是将墨盒中的墨汁分别用四种碱基合成试剂所替代,支持物经过包被后,通过计算机控制喷墨打印机将特定种类的试剂喷洒到预定的区域上。冲洗、去保护、偶联等则同于一般的固相原位合成技术。如此类推,可以合成出长度为 40 到 50 个碱基的探针,表面氨基修饰,每步产率也较前述方法为高,可达到 99% 以上。
基因芯片又称为DNA微阵列(DNA microarray),可分为三种主要类型:1)固定在聚合物基片(尼龙膜,表面氨基修饰的微塑料,纤维膜等)表面上的核酸探针或cDNA片段,硅片表面氨基修饰,通常用同位素标记的靶基因与其杂交,通过显影技术进行检测。这种方法的优点是所需检测设备与目前分子生物学所用的显影技术相一致,相对比较成熟。但芯片上探针密度不高,样品和试剂的需求量大,定量检测存在较多问题。
目前,由于灵敏度所限,多数方法需要在标记和分析前对样品进行适当程序的扩增,不过也有不少人试图绕过这一问题,如 Mosaic Technologies 公司引入的固相 PCR 方法,引物特异性强,无交叉污染并且省去了液相处理的烦琐; Lynx Therapeutics 公司引入的大规模并行固相法 (Massively parallel solid-phase cloning) ,可在一个样品中同时对数以万计的 DNA 片段进行,且无需单独处理和分离每个。
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