共价偶联比物理吸附更先进一些，主要表现在它克服了物理吸附的两个缺点：共价偶联在固体表面的抗体（1）排列取向一定程度上是确定的；（2）不容易脱离到溶液中。赖氨酸、谷氨酸和天冬氨酸等氨基酸经常被作为蛋白质修饰的靶点，其中赖氨酸尤甚（Chem. Sci.， 2017，表面氨基修饰厂家，8，表面氨基修饰的方法， 63-77，Chem. Sci.， 2018， 9， 79–87），其它氨基酸由于位于蛋白质内部或反应性弱或不可控等原因而很少用于偶联。
与其他芯片制作技术相比较，微珠芯片具有如下优势:
(1) 密度高微珠芯片的点样密度是原位光合成法的16倍，喷点法的100倍，接触式点样的400倍。
(2)测试重复性好鉴 于超高密度的特点，微珠芯片中每个样品都能保证约30个重复，从而保证测试的高重复性、高重复串以及高可靠性。
(3)定制方便若需要在已完成的芯片中增加测试点或新基因，只要合成相应的微珠加入到微珠混合池中即可。
(四)基因芯片数据分析
基因芯片分析包括五个基本步骤:生物学问题、样品制备、生物化学反应、检测、数据模型分析。基因芯片数据分析包括两部分，数据可靠性分析和生物学意义分析。
正如电子管电路向晶体管电路和集成电路发展时所经历的那样，核酸杂交技术的集成化也已经和正在使分子生物学技术发生着一场革命。现在全世界已有十多家公司专门从事基因芯片的研究和开发工作，广东表面氨基修饰，且已有较为成型的产品和设备问世。主要代表为美国 Affymetrix 公司。该公司聚集有多位计算机、数学和分子生物学，表面氨基修饰公司，其每年的研究经费在一千万美元以上，且已历时六七年之久，拥有多项。
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